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我在CNS图表复现09—上皮细胞可以区分为恶性与否,简单演示了,第一次分群后选择上皮细胞后继续分群,第1,2,7,14,21,23,25是跨越病人的聚类情况,所以初步判定它们这些亚群是正常的上皮细胞。因为目前主流看法是每个病人的恶性肿瘤细胞都是没办法跨越病人进行聚类的。
但最常规做法是使用inferCNV算法可以区分细胞恶性与否。比如online29April的文章《Single-CellTranscriptomeAnalysisRevealsIntratumoralHeterogeneityinccRCC,whichResultsinDifferentClinicalOut