北京哪家白癜风医院看得好 http://www.bdfyy999.com/index.html今天给大家分享的是年4月份发表在NaturereviewsClinicalOncology(IF=53.)上的综述Applyinghigh-dimensionalsingle-celltechnologiestotheanalysisofcancerimmunotherapy。本文阐述了使用以scRNA-seq为主的单细胞分析技术取得的进展,特别是在肿瘤临床治疗、免疫疗法方面,讨论了单细胞方法在回答重要研究问题方面日益增长的效用。本文篇幅较长,在尊重原文框架的基础上结合小编的理解帮大家梳理了一下核心论点和经典案例,方便大家快速了解单细胞测序以及肿瘤免疫的最新进展,现将大纲列出。0背景0.1单细胞测序相比于传统bulk测序的技术优势。肿瘤是一个复杂的恶性肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞的混合体,具有瘤内异质性和瘤间异质性(Figure1)。整个肿瘤微环境当中包括了促进肿瘤和抑制肿瘤的各种信号来调控肿瘤生长和肿瘤进化。传统意义上的bulk基因组和转录组分析已经提供了大量的关于肿瘤生长、进化的视角,但是一些特异的细胞群体或细胞状态所展示的信号会在bulk测序时被掩盖,而这种特异的细胞群体或状态有时也是非常关键的,比如肿瘤干细胞和对于肿瘤治疗应答相关的免疫细胞。因此,在基因组、转录组、表观组和蛋白质组层面对细胞个体进行检查能够克服传统bulk层面的限制,进行更加精细的细胞、分子水平的剖析。
Figure1肿瘤微环境的组成
TherapeuticTargetingoftheTumorMicroenvironment,Bejarano,,CancerDiscovery
0.2单细胞测序技术及分析方法的快速发展。由于测序技术和细胞分离技术的快速发展,测序细胞数量由最初的几百个细胞发展到成千上万个细胞,并且测序性价比越来越划算。分析方法也在持续改进,包括细胞类型的确定、高维数据的降维、无监督聚类、系统发生建模、轨迹推断、RNA速率、多数据集的协同分析等。0.3肿瘤免疫学中悬而未决的科学问题。肿瘤和免疫细胞异质性,特别是抗原呈递分子表达的异质性、T细胞克隆型与表型的关系、TME中免疫检查点相互作用的网络、肿瘤细胞与免疫细胞之间以及不同免疫细胞类型之间的空间功能关系等。在此,我们