在短短几年时间里,CRISPR/Cas9作为一种稳定、高效、简单、广泛应用的基因编辑技术迅速出现并发展起来。事实上,CRISPR/Cas9已经从根本上影响了许多领域,如农业、生物技术和生物医学,但从快速增长的出版物中积累的数据可以证明,没有哪个领域比癌症研究受到的影响更深远。本文将盘点近期CRISPR/Cas9的技术应用进展和突破,以供大家参考:
NatCommun:利用CRISPR/dCas9靶向阻断DNA甲基转移酶,可揭示特定启动子上DNA去甲基化的功能作用
-11-22报道,在一项新的研究中,来自加拿大麦吉尔大学的研究人员展示了他们如何通过使用CRISPR/dCas9基因组编辑技术,在体外培养的小鼠和人类细胞中成功地去除特定基因的DNA甲基化。相关研究结果近期发表在NatureCommunications期刊上,论文标题为“UnravelingthefunctionalroleofDNAdemethylationatspecificpromotersbytargetedstericblockageofDNAmethyltransferasewithCRISPR/dCas9”。
在体外,利用CRISPR/dCas9阻断DNA甲基转移酶
他们发现,这种DNA“去甲基化”活动可以靶向DNA中的任何地方---任何感兴趣的基因---而无需编辑遗传密码,并且在DNA中不希望出现的位置没有脱靶编辑。他们还描述了完全去除DNA甲基标记所需的方法,希望世界各地的科学家们能够利用这种新技术开始发现本应开启的因发生DNA甲基化而被关闭的基因---例如,糖尿病患者中的胰岛素编码基因,并利用这种技术建立疾病治疗的新模式。
原文:DanielM.Sapozhnikovetal.UnravelingthefunctionalroleofDNAdemethylationatspecificpromotersbytargetedstericblockageofDNAmethyltransferasewithCRISPR/dCas9.NatureCommunications,,doi:10./s---9.
CRISPR/Cas9组合筛选揭示了人类乳腺癌中相互作用的肿瘤抑制基因和治疗靶点的上位性网络
-10-27报道,最近,将聚合CRISPR筛选与单细胞转录组读数结合在一起的高含量表型方法已经出现,使得基于生长的表型效应可以与转录组范围的变化并行分析。这些工具和技术为人们提供了一个机会,系统地分析灭活的抑癌基因组合如何改变人类乳腺上皮细胞的生长特性和基因表达谱,以确定驱动基因合作的一般机制。人类乳腺癌基因组数据指导了作者的研究,也被用来作为实验转录组结果的基准。
TSG对的扰动促进体内肿瘤的发生。
该研究的一个重要结果是,它证明了任何癌症的驱动基因相互作用可以系统地绘制,使用组合CRISPR筛选肿瘤生长或其他与转录组广泛变化并行的生理相关的生长效应。虽然可以不经筛选就发现上位性表达变化,但可以相信未来的工作是系统性的是很重要的。
作者发现,通过TP53和其他肿瘤抑制基因的改变,在乳腺癌细胞中协同上调的基因之一是CDK4,它编码FDA批准用于治疗转移性ER+/HER2乳腺癌药物的靶标。然而,目前没有数据表明TP53状态是否可以作为CDK4抑制剂的有用生物标志物。作者承认,该工作目前只是开放这一领域的第一步,并理解临床应用还有很长的路要走。在不就的将来期,严格测试协同改变基因的功能影响和药物性将是重要的,以确定它们是否可能成为抑制致瘤性的有用靶点。
原文: