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公开发表交大教授取得这一恶性肿瘤研究重 [复制链接]

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肝内胆管癌是仅次于肝细胞肝癌的第二大常见原发性肝恶性肿瘤,近年来发病率呈增长趋势,具有起病隐匿、高度侵袭、高度异质、预后不良等特点。近日,西安交通大学电信学部自动化学院叶凯教授与华中科技大学李蕾教授团队在相关领域取得了重要进展,并在国际医学期刊《肝病学》(IF:17.)发表题为“基于单细胞转录组的肝内胆管癌起始发展细胞异质性研究”的研究论文。西安交通大学为论文第一作者单位,西安交通大学电信学部自动化学院王庭杰博士生与华中科技大学徐传瑞教授为文章共同第一作者。

肝内胆管癌起病隐匿、高异质性是影响肝内胆管癌靶向及免疫治疗效果的重要因素。为解析肝内胆管癌发展不同时期肿瘤组织内部的动态异质性,依托于西安交通大医院单细胞测序平台,Med-X研究院数字医学研究所,电子与信息研究院生物信息学研究所三个干湿结合平台,团队建立肝内胆管癌小鼠模型,采集时序单细胞转录组数据,整合多维组学数据,分析验证了调控肿瘤异质性的关键调控网络、早期起源细胞、关键驱动基因、内皮纤维细胞在肿瘤发生发展过程中的动态相互作用。

研究发现,在肝内胆管癌肿瘤细胞中存在应激反应和增殖性肿瘤亚型。使用基因共表达、图网络挖掘等机器学习方法首次发现两种肿瘤亚型中异质性的转录因子及调控网络。首次发现并验证肝脏内部上皮细胞从分化到癌化过程中的关键驱动基因,并首次发现顶端内皮细胞在响应纤维细胞刺激的同时促进纤维细胞的重塑,最终促进肿瘤细胞增殖的动态过程及分子机制,本研究报道的多种关键细胞类型和驱动基因提升了领域对肝内胆管癌的发病机制及瘤内导质性的认识,为诊断和治疗提供了新的靶点。

西安交通大学坚持面向世界科技前沿、面向经济主战场、面向国家重大需求、面向人民生命健康,不断增强科技创新能力,提升科技竞争力。迁校以来,创造了百余项国内外科学研究领域的“第一”,在抢占科研制高点方面发挥了交大的引领作用。在新的历史起点上,西安交通大学将聚焦立德树人根本任务,坚定不移地推进综合改革,推进“双一流”建设,推进内涵式发展,奋力书写新时代学校发展新篇章,朝着中国特色世界一流大学奋进。

拓展阅读:

叶凯,西安交通大学电信学部教授,博导,获国家杰出青年科学基金,科技部重大专项等资助。研究对象从蛋白质序列到基因组的转变,曾开发了以Pindel、MSIsensor为代表的系列基因组变异检测方法,受邀参加千人基因组(TheGenomesProject)、肿瘤基因组路线图计划(TheCancerGenomeAtlas,TCGA)等多项国际基因组项目。年2月来到西安交通大学就职,在电信学部组建信息学与生命科学相结合的交叉学科团队,继续深入研究结构变异的检测、表征和功能。

叶凯教授致力于解决精准医学带来的相关生物信息科学问题,他带领团队从事计算机、生命科学、医学的交叉研究工作,以人工智能算法开发、生物医学大数据挖掘为手段,从事攻克人类重大疾病、物种跳跃式进化等方面的研究;开发了一系列基因组测序数据分析解决方案,部分成果作为该领域的核心方法,被世界一流大学、医院、科研机构广泛使用。

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